الكيمياء واختلاف المادة و كيفية تفاعل الذرات لتكوين الجزيئات وكيفية تفاعل الجزيئات مع بعضها البعض كل هذا مرتبط بدراسه العلم وتفاعلات المادة وعلاقتها بالطاقة كل ماتريد معرفة عن الكيمياء في موقع ويكي العربي فتابعونا .
ليس للجزيئات الثنائية الذرة من وسطاء نحددها سوى البعد بين الذرتين و شدة الترابط بينهما. أما بالنسبة للجزيئات الثلاثية الذرة فإنه من الضروري تحديد الزوايا بين الخطوط الواصلة بينها، إضافة إلى أطوالها و قوة الروابط، ولابد من الكلام أيضاً عن ترتيب الذرات لإتمام الوصف.
ففي جزيئة الماء مثلاً، المكونة من ذرتي هدروجين وذرة أكسجين تكون الزاوية مساوية 105 ْ والترتيب H-O-H، وليس O-H-H، أما في حالة ثنائي أكسيد الكربون فالترتيب O-C-O والزاوية قرابة 180 ْ.
وتبدأ الصورة الثلاثية الأبعاد بالظهور عندما يزيد عدد الذرات على الثلاث، إذ ليس من الضروري عندئذ أن تبقى الذرات موزعة في مستو واحد أي مسطحة. فجزيئة الميثان CH4 مثلاً، يرتبط فيها أربع ذرات هدروجين بذرة كربون وفق أحرف رباعي وجوه تشغل ذرة الكربون مركزه وذرات الهدروجين رؤوسه.
ويمكن أن تستبدل بذرة الهدروجين مجموعة CH3 وتستمر هذه العملية لنحصل على سلسلة تكوّن نوع مما يعرف بالفحوم الهدروجينية (الكربوهدروجينية) المختلفة باختلاف هندستها. فقد تتشكل فحوم هدروجينية حلقية مغلقة أو شبه مغلقة.
وقد ساعدت مثل هذه الدراسات البنيوية في تصنيع كثير من المواد المشابهة للمواد الطبيعية، إضافة إلى اقتراح مواد جديدة ذات خواص مميزة. يطلق على جزيئاتها اسم البنية مثل المكعبية والنجمية والموشورية أو ذات الكرسي أو القاربية وغير ذلك .
وكما حصل لدى دراسة بنية المواد العضوية التي أساسها الكربون والهدروجين، تبين أن السليكون والأكسجين هما أساس الفلزات الطبيعية حيث تقوم الرابطة والبنية بدور حاسم في تحديد خواصها.
تمثل الوحدة O-Si الوحدة الرئيسة في هيكل البنية فإذا تكررت بضع وحدات فقط تشكلت صخور طرية كالصخور الحوارية، أما إذا تكونت سلاسل طويلة صارت البنية ليفية مثل الأسبيستوس أو قد تشكل بنية ثنائية البعد صفيحية مثل الميكا، بينما يمثل الكوارتز البنية الثلاثية الأبعاد المرتبطة بقوى متقاربة الشدة في الأبعاد الثلاثة.
